医院简介:
上海市东方医院(同济大学附属东方医院)始建于1920年,地处浦东新区,是一所集医疗、教学、科研、急救、预防、康复、保健于一体的大型三级甲等综合性医院,设61个临床、医技科室,核定床位2000张,年门急诊人次超过300万,其中外籍患者逾4万人次,医院现有职工2800余名。
医院建有张江国家自主创新示范区干细胞转化医学产业基地、国家干细胞库等与国际接轨的科研平台,是国家首批干细胞临床研究备案基地。2016年疾病综合救治指数在上海市医院系统排名第8位,中国医院科技影响力排名第61位,自然指数(Nature Index)最高排名为全国医院第8位(2016年时段排名),2017年获批国家自然科学基金中标61项,在全国医院系统中排名第20位。
建库背景:
干细胞又被称为“万能细胞”具有修复各种组织功能和再生器官的能力,可用于细胞治疗、组织工程、药物筛选、基因功能研究等多种疾病治疗。干细胞研究已经成为国际热点。干细胞及转化研究领域成了国家“十三五”科技创新规划中明确指出的战略性、前瞻性重大科学问题之一,2017年国家用于干细胞研究的重点专项经费更是高达9.4亿元。
2014年,上海市张江高新区管委会投入巨资打造干细胞转化医学产业基地,上海东方医院集聚由于聚集包含3名院士在内的全球200余位干细胞人才成了领头单位,承担打造包含再生医学研究所、干细胞制备与质检平台和干细胞产品中试验平台为主的完备的干细胞研发、产业化基地和公共服务平台,参与建设具有全球影响力的科技创新中心重任。
同年10月,东方医院以责任单位的身份,获批《上海张江国家自主创新示范区干细胞转化医学产业基地》项目,聚焦骨髓间充质干细胞治疗心力衰竭、视网膜前体细胞治疗帕金森氏病、脂肪间充质血管成分治疗骨关节炎三个重大科研方向。项目总建设经费高达2.55亿元,其中政府资助1.05亿元,东方医院匹配和社会融资1.5亿元。
建库目的:
2012年11月23日,东方医院“干细胞工程转化医学中心”成立。
同济大学附属东方医院于2013年2月8日联合中国科学院上海高等研究院等五方单位共同签署战略合作框架协议,成立东方医院“干细胞工程转化医学中心”
该中心以实现干细胞和纳米靶向技术向临床产业转化为战略目标,工程主要包括:实现干细胞科研成果和纳米靶向治疗技术向临床及产为的转化,取得企业对干细胞和纳米靶向治疗产业化,临床试验和临床转化资金支持,探索干细胞领域产、学、研、临床转化四位一体的可行有效模式。
本次战略合作框架的确立,将进一步推动东方医院“干细胞工程转化医学中心”科研工作的进展,中心未来着力于干细胞库建立,脂肪干细胞治疗皮肤损伤、缺血性心力衰竭及免疫细胞治疗肿瘤等方面,与华盛顿国外大学医学中心进一步合作,力图使科研成果尽快转化为临床资源,为患者服务。
临床级细胞库信息管理系统建设五大目标
定 位 高 :力争牵头制定相关行业标准, 乃至上海与国家标准
范 围 广 :信息管理系统要能够覆盖临床部、制备部、检测部、样本部、信息部、质量部、财务部、市场运营部等信息,并贯通整个信息链条
内 涵 深 :诸如细胞样本功能、活力及遗传信息等也应体现
覆 盖 全 :以受试者为中心,收集全部临床信息、随访信息和遗传信息等
创 新 性 :信息管理系统采用最先进理念、最合理构架与最优配套设施。
通过上海唐颐信息技术有限公司与东方医院、上海生物信息技术研究中心等共同努力,力争使之成为协同创新平台
细胞库信息管理系统规范化建设
2015年上海唐颐与与上海市东方医院干细胞工程转化医学中心达成战略合作伙伴,建设临床级细胞库信息管理系统,2017年3月签订正式合作协议,项目实施分三阶段
一阶段:临床数据整合与样本管理(2015年—2017年)
二阶段:数据整理及样本库信息系统建设(2017年—2018年)
三阶段:信息化平享平台建设(2018—至今)
上海市东方医院生物样本库创建于2015年,是国内首家集干细胞资源和其他样本资源为一体的标准化样本库一期投资金额约3000万元,占地面积约550平方米目前拥有种子库、主库、工作库、产品库、第三方细胞储存中心五大功能的干细胞资源库
目前东方医院生物样本库可贮存样本量达300万份功能区域涵盖细胞存储区(细胞种子库、主细胞库与工作细胞库)、组织样本存储区(深低温、冰箱区和气相液氮罐区)、病理蜡块贮存室、组织样本处理区、质控区、细胞收发区、组织样本收发区、档案室、总控室、库房等生物样本库现配有气相液氮罐44台(液氮罐配备自动化液氮管道和液氮供应塔)、深低温冰箱15台并配备冷链监控系统以及拥有离心机、生物安全柜、纯水机、PCR仪、酶标仪等仪器设备总价值约2500万元
样本库内走廊
细胞收发区
深低温冰箱存储
病理蜡块存储区
液氮存储区
质控室
目前已经建立的三大医院信息系统
临床资料数据库系统,用于临床数据的抽取、存储支持平台降低了医院业务系统的负荷,同时对临床数据的统一存储管理,有利于临床数据的准确性和一致性,方便数据的查询搜索。
干细胞临床研究项目管理系统,优化了干细胞临床研究试验管理和执行流程,以便于提高干细胞临床试验的质量协助研究者更便捷的完成科学研究。
其功能有干细胞临床研究项目管理、学术委员会管理、伦理委员会管理、项目信息管理、供体管理、受试者信息管理、生物样本采集、随访管理、电子病例设计器管理、经费管理、质量控制、设备管理、培训管理、文件管理、科研项目管理、系统设置、工作人员履历管理等。
临床数据与样本资源库管理系统优化了样本的存储和管理流程, 以便于后期样本的使用和价值最大化。生物样本库管理子系统实现的功能有容器管理、样本管理、样本管理、数据管理、随访管理、质控管理、统计分析、报瞥管理、操作日志管理、用户组和样本组管理、题库和问卷管理、条形码打印、系统设置、组合查询等。
唐颐建设信息库采用采用国际医学标准编码,实现了与HIS系统对接获取临床信息,结构化信息采集处理(各病种、各项目不同的词条)安全管理、信息去隐私化处理,实现了与数字病理库的无缝对接,并关联了知情同意书。
为保证快速、准确地存取样本,唐颐样本库团队结合医院实际需求,研发了同时适用于预制二维码和贴码管两套业务流程的信息系统。该系统设置两套操作界面,可以满足生物样本库工作人员和临床研究人员同时査看库内样本与数据情况的需求。
样本库功能示意图
唐颐临床生物样本库系统开发了门诊、病房和手术室预约功能,缩短了留取、使用样本的操作步骤和时间,保证各样本存用等环节操作及时完成。与医院信息科充分沟通协商,将该系统与门诊检验信息系统、病房医院信息系统、临床随访系统和结构化电子病历系统等对接绑定,通过该系统可以直接检索患者随访和结构化电子病历信息,抓取临床科研所需信息点,实现了电子病历——生物样本库——随访系统的集成化临床医学研究平台建设,为实现规范诊疗、定期随访、标准化样本采集和科学真实数据分析奠定了良好基础。
与此同时,唐颐样本库信息管理系统增加了温控报警、软件模块,如遇低温冰箱损坏或断电等意外情况造成冰箱及各储存房间温湿度浮动较大时,系统将自动发送提醒短信至工作人员,保障了生物样本库运营环境的安全可靠。
临床生物样本库的服务类型涵盖了样本采集、处理、质控、入库、储存管理和运输全流。提供各类临床样本的采集、处理、DNA/RNA提取、组织样本、制备、切片、HE及免疫组织化学染色、数字病理切片等工作。并提供各类生物样本深低温冻存技术咨询服务。
唐颐-东方医院临床级细胞库信息管理系统特色功能介绍
对样本存储的容器结构、容器类型等的管理,支持用户自定义容器结构、容器类型等,
系统支持立式冰箱,卧式冰箱,冷藏柜,液氮罐,切片柜,石蜡柜
支持根据项目编号、样本类型、器官代码三种条件为依据,进行容器位置的自动分配。可支持两种设置途径:
1.空冷冻盒的第一次入样的样本信息为设定条件;
2.直接对容器进行设置,绑定条件。
支持自由组合拼接所需的查询条件及列头,通过患者基本信息、临床信息等以及样本相关信息进行组合查询所需样本及患者,便于在海量样本数据中精准查找和展示所需样本信息及相关患者信息,方便快捷,精确可靠。
上海唐颐公司总经理唐万介绍说:在东方医院临床级细胞库信息管理系统开发过程中,我们遇到了三个难点,一是样本预处理的复杂性,二是统计报表的多样性,三是自动给位功能的创新性,但我们的优秀研发团队全力配合医院的各类项目需求,排除万难,圆满地完成了建设任务。
东方医院干细胞转化医学中心获得了上海张江国家自主创新示范区干细胞转化医学产业基地及上海首批”四新” 基地·上海市干细胞学产业基地转化医学产业基地
项目负责人、同济大学附属东方医院院长刘中民介绍,上海张江国家自主创新示范区干细胞转化医学产业基地项目,以创新合作模式整合世界一流的医疗、科研、产业、资本等资源合作运营,由东方医院、中科院高研院、同济大学、联兆投资等共同推动,建立干细胞制备与质检服务平台、干细胞技术产品中试平台、干细胞产业推广服务平台三大平台,开展干细胞产业发展工作。
通过该项目,将在心衰治疗、关节炎治疗、帕金森氏综合症治疗、免疫疾病治疗等方面取得突破性进展,并希望通过该项目的产业成果与公共服务能力,推动上海张江国家自主创新示范区的生物医药产业服务能力和产业发展能力进入世界一流行列。依托上海唐颐联合东方医院打造国内首套临床级细胞库信息管理系统展开干细胞领域产、学、研、临床转化四位一体模式探索。

唐颐与上海东方医院后续合作:
由上海市东方医院(南院)主办,上海唐颐信息技术有限公司协办《全国首届临床级干细胞库国家级继续医学教育项目暨干细胞库的标准化建设及质量管理体系培训班》大会于2017年10月19日在上海市东方医院(南院)成功召开,历时3天,会议中19位干细胞制备管理、质量管理、标准化建设等行业内专家分享了建库方案及相关工作流程与经验。
中国医药生物技术协会组织生物样本库分会推荐品牌